Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2f1Q3THK3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2f1Q3THK3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 378.5 ms