Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Samd11Q1RNF8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 542.3 ms