Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 LINC00969-301ENST00000628053 582 ntTSL 59.28□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-262ENST00000625971 615 ntTSL 59.1□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-224ENST00000594446 740 ntTSL 58.84□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-306ENST00000628439 864 ntTSL 58.1□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-340ENST00000631352 523 ntTSL 58.09□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-302ENST00000628125 668 ntTSL 57.96□□□□□ -1.145e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-341ENST00000631359 702 ntTSL 57.85□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 31.9
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PCBP1Q15365 LINC00969-300ENST00000628003 511 ntTSL 57.25□□□□□ -1.255e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-315ENST00000629511 393 ntTSL 57.17□□□□□ -1.265e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.275e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-269ENST00000626233 644 ntTSL 56.76□□□□□ -1.335e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-240ENST00000600382 599 ntTSL 56.66□□□□□ -1.345e-7■■■■■ 31.9
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PCBP1Q15365 LINC00969-337ENST00000631263 455 ntTSL 56.37□□□□□ -1.395e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-311ENST00000628754 430 ntTSL 55.03□□□□□ -1.65e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 NPRL3-204ENST00000456528 794 ntTSL 515.86■□□□□ 0.139e-18■■■■■ 31.9
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PCBP1Q15365 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.567e-15■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 CD276-206ENST00000559073 1844 ntTSL 1 (best)15.37■□□□□ 0.057e-15■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 CD276-207ENST00000559465 1620 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.017e-15■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.327e-15■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 CD276-208ENST00000559978 503 ntTSL 211.46□□□□□ -0.577e-15■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LRP1-211ENST00000556356 5114 ntTSL 216.05■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 31.8
PCBP1Q15365 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 31.8
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PCBP1Q15365 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 31.8
PCBP1Q15365 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 31.8
PCBP1Q15365 SYVN1-206ENST00000526060 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 31.8
PCBP1Q15365 SYVN1-204ENST00000449943 4547 ntTSL 211.38□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 31.8
PCBP1Q15365 ZYX-202ENST00000354434 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.67■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 31.7
PCBP1Q15365 S100A1-203ENST00000368698 784 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.462e-16■■■■■ 31.7
PCBP1Q15365 S100A1-205ENST00000469893 2621 ntTSL 1 (best)11.95□□□□□ -0.52e-16■■■■■ 31.7
PCBP1Q15365 S100A1-201ENST00000292169 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-16■■■■■ 31.7
PCBP1Q15365 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.911e-19■■■■■ 31.7
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PCBP1Q15365 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.11e-8■■■■■ 31.7
PCBP1Q15365 CD151-220ENST00000532045 1803 ntTSL 521.66■■□□□ 1.061e-8■■■■■ 31.7
PCBP1Q15365 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.941e-8■■■■■ 31.7
PCBP1Q15365 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.711e-8■■■■■ 31.7
PCBP1Q15365 CD151-218ENST00000530726 1407 ntTSL 514.8□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 31.7
PCBP1Q15365 CD151-205ENST00000525181 364 ntTSL 39.99□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 31.7
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PCBP1Q15365 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.944e-6■■■■■ 31.5
PCBP1Q15365 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 31.5
PCBP1Q15365 YIPF2-212ENST00000592646 950 ntTSL 319.9■□□□□ 0.784e-6■■■■■ 31.5
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PCBP1Q15365 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.294e-11■■■■■ 31.5
PCBP1Q15365 PCGF2-207ENST00000620225 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.644e-11■■■■■ 31.5
PCBP1Q15365 MPZ-205ENST00000526189 957 ntTSL 321.16■□□□□ 0.983e-8■■■■■ 31.3
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PCBP1Q15365 MPZ-201ENST00000463290 1693 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.213e-8■■■■■ 31.3
PCBP1Q15365 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 31.3
PCBP1Q15365 LTBP4-204ENST00000318809 1700 ntTSL 219.16■□□□□ 0.662e-29■■■■■ 31.3
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PCBP1Q15365 LTBP4-229ENST00000601032 2019 ntTSL 1 (best)17.11■□□□□ 0.332e-29■■■■■ 31.3
PCBP1Q15365 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.787e-8■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 REEP6-203ENST00000395484 611 ntTSL 513.09□□□□□ -0.317e-8■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.314e-11■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 ZYX-204ENST00000436448 632 ntTSL 419.96■□□□□ 0.791e-8■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 INTS11-242ENST00000531377 816 ntTSL 519.38■□□□□ 0.694e-11■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.484e-11■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.274e-11■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 INTS11-227ENST00000525603 738 ntTSL 316.03■□□□□ 0.164e-11■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.224e-11■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 ASPH-208ENST00000517856 6337 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.374e-11■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 INTS11-245ENST00000533916 405 ntTSL 212.63□□□□□ -0.394e-11■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 ASPH-201ENST00000356457 3730 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 INTS11-212ENST00000462432 2863 ntTSL 1 (best)11.49□□□□□ -0.574e-11■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 PSME3-205ENST00000545225 3082 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.574e-11■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 PSME3-201ENST00000293362 3144 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.714e-11■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 ASPH-225ENST00000522835 1258 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 ASPH-207ENST00000517847 1947 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 31.2
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