Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSHL1Q14406 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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