Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCGQ13326 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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