Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 GDF15-205ENST00000604609 506 ntTSL 36.02□□□□□ -1.452e-9■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TPD52-208ENST00000518517 584 ntTSL 45.94□□□□□ -1.464e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-209ENST00000438191 426 ntTSL 55.64□□□□□ -1.514e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-210ENST00000438204 796 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.514e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-212ENST00000441588 496 ntTSL 45.62□□□□□ -1.514e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.514e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-207ENST00000435437 858 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.544e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.584e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-203ENST00000408981 737 ntTSL 55.07□□□□□ -1.64e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-204ENST00000411934 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.64e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-211ENST00000438265 668 ntTSL 35.06□□□□□ -1.64e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TMCO3-204ENST00000462877 491 ntTSL 24.96□□□□□ -1.624e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.644e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 RPE-215ENST00000453724 546 ntTSL 53.89□□□□□ -1.794e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 PECR-204ENST00000464722 640 ntTSL 43.83□□□□□ -1.84e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 TPD52-210ENST00000519250 585 ntTSL 43.57□□□□□ -1.844e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 DIP2B-204ENST00000549620 2676 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.14e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.444e-6■■□□□ 11.4
SRSF9Q13242 SRSF1-206ENST00000583741 1465 ntTSL 512.79□□□□□ -0.361e-9■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-9■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.631e-9■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.641e-9■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.81e-9■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 SRSF1-204ENST00000581979 1720 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.061e-9■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 SRSF1-207ENST00000584668 758 ntTSL 35.24□□□□□ -1.571e-9■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 SRSF1-203ENST00000581497 438 ntTSL 34.83□□□□□ -1.641e-9■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.991e-9■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.082e-13■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.012e-13■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 02e-13■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.112e-13■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 PEG3-209ENST00000599577 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.372e-13■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 PEG3-207ENST00000599534 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.562e-13■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.772e-13■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 ZIM2-203ENST00000595671 2054 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.942e-13■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.192e-13■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 ZIM2-207ENST00000601070 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.222e-13■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 ZIM2-205ENST00000597281 2037 ntTSL 1 (best)6.54□□□□□ -1.362e-13■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 SNAPC3-203ENST00000421710 730 ntTSL 515.45■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.023e-6■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 SNAPC3-206ENST00000490969 2524 ntTSL 1 (best)14.79□□□□□ -0.043e-6■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 SNAPC3-205ENST00000467062 2574 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.183e-6■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.343e-6■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 SNAPC3-204ENST00000461041 403 ntTSL 212.33□□□□□ -0.443e-6■□□□□ 11.3
SRSF9Q13242 CSNK1D-222ENST00000584377 2891 ntTSL 29.81□□□□□ -0.845e-11■□□□□ 11.2
SRSF9Q13242 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.581e-14■□□□□ 11.2
SRSF9Q13242 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.281e-14■□□□□ 11.2
SRSF9Q13242 PANK2-202ENST00000336066 1843 ntTSL 1 (best)16.61■□□□□ 0.251e-14■□□□□ 11.2
SRSF9Q13242 ARFGAP1-217ENST00000523114 579 ntTSL 412.02□□□□□ -0.491e-14■□□□□ 11.2
SRSF9Q13242 PANK2-205ENST00000495692 967 ntTSL 311.82□□□□□ -0.521e-14■□□□□ 11.2
SRSF9Q13242 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.741e-14■□□□□ 11.2
SRSF9Q13242 ARFGAP1-216ENST00000522959 556 ntTSL 29.61□□□□□ -0.871e-14■□□□□ 11.2
SRSF9Q13242 ARFGAP1-219ENST00000524192 980 ntTSL 28.99□□□□□ -0.971e-14■□□□□ 11.2
SRSF9Q13242 ARFGAP1-223ENST00000550188 572 ntTSL 57.41□□□□□ -1.221e-14■□□□□ 11.2
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SRSF9Q13242 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.569e-9■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 AL132780.3-201ENST00000555074 835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.389e-9■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 WDR27-210ENST00000496752 1562 ntTSL 512.41□□□□□ -0.422e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.832e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.194e-8■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.414e-8■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NAP1L1-212ENST00000547993 2481 ntTSL 1 (best)4.95□□□□□ -1.624e-8■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NAP1L1-211ENST00000547969 543 ntTSL 43.23□□□□□ -1.894e-8■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NAP1L1-208ENST00000547529 892 ntTSL 52.96□□□□□ -1.944e-8■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NEU4-211ENST00000435855 2281 ntTSL 216.15■□□□□ 0.187e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.17e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.097e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.067e-6■□□□□ 11.1
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SRSF9Q13242 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.037e-6■□□□□ 11.1
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SRSF9Q13242 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.027e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.017e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.017e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.037e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.057e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.147e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NEU4-217ENST00000618597 3013 ntTSL 213.8□□□□□ -0.27e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.217e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.247e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.277e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-212ENST00000433104 2490 ntTSL 213.27□□□□□ -0.291e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 ARHGEF28-205ENST00000503341 1926 ntTSL 213.23□□□□□ -0.297e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 F2-202ENST00000442468 1031 ntTSL 312.97□□□□□ -0.337e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.47e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.437e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 TAF1C-219ENST00000568265 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 412.21□□□□□ -0.457e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 PHPT1-205ENST00000492540 1316 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.497e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NEU4-207ENST00000420288 845 ntTSL 311.86□□□□□ -0.517e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 UBE2D2-204ENST00000505007 1170 ntTSL 311.84□□□□□ -0.517e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 PLXNB1-209ENST00000466353 626 ntTSL 311.56□□□□□ -0.567e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NEU4-206ENST00000415936 860 ntTSL 311.1□□□□□ -0.637e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NEU4-208ENST00000423583 753 ntTSL 510.89□□□□□ -0.677e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.677e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NEU4-210ENST00000428592 505 ntTSL 410.77□□□□□ -0.697e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.72e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-227ENST00000479914 1077 ntTSL 1 (best)10.55□□□□□ -0.721e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.737e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 NEU4-209ENST00000426032 676 ntTSL 310.13□□□□□ -0.797e-6■□□□□ 11.1
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