Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALCOCO2Q13137 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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