Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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TRAF3Q13114 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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TRAF3Q13114 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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TRAF3Q13114 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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TRAF3Q13114 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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TRAF3Q13114 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF3Q13114 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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