Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFIAQ12857 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
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