Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.492e-32■□□□□ 9.5
GRSF1Q12849 SLC16A3-216ENST00000583025 955 ntTSL 220.38■□□□□ 0.852e-32■□□□□ 9.5
GRSF1Q12849 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.72e-32■□□□□ 9.5
GRSF1Q12849 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.72e-32■□□□□ 9.5
GRSF1Q12849 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.542e-32■□□□□ 9.5
GRSF1Q12849 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.542e-32■□□□□ 9.5
GRSF1Q12849 SLC16A3-213ENST00000582715 279 ntTSL 516.47■□□□□ 0.232e-32■□□□□ 9.5
GRSF1Q12849 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-32■□□□□ 9.5
GRSF1Q12849 RPS17-207ENST00000560639 932 ntTSL 55.23□□□□□ -1.573e-14■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 SLC25A10-207ENST00000574129 1523 ntTSL 531.69■■■□□ 2.662e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.239e-9■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.032e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 PCYT2-207ENST00000571581 999 ntTSL 527.49■■□□□ 1.999e-9■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.939e-9■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 PCYT2-213ENST00000573401 1028 ntTSL 525.84■■□□□ 1.739e-9■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 PCYT2-214ENST00000573636 913 ntTSL 525.51■■□□□ 1.679e-9■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.579e-9■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.52e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 PCYT2-218ENST00000576343 1006 ntTSL 524.04■■□□□ 1.449e-9■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.398e-12■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.39e-9■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.289e-9■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 PCYT2-210ENST00000572473 575 ntTSL 522.11■■□□□ 1.139e-9■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 RBL1-204ENST00000527999 599 ntTSL 521.82■■□□□ 1.082e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DLG1-204ENST00000392381 2833 ntTSL 1 (best)21.26■□□□□ 0.991e-7■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.882e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.82e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.438e-12■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.398e-12■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DDX42-212ENST00000581135 589 ntTSL 417.27■□□□□ 0.368e-12■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 P2RY11-202ENST00000471843 554 ntTSL 416.48■□□□□ 0.232e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.222e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 SLC25A10-204ENST00000570310 595 ntTSL 316.19■□□□□ 0.182e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.132e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.128e-12■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DLG1-207ENST00000419227 1771 ntTSL 215.44■□□□□ 0.061e-7■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 SLC25A10-208ENST00000574884 726 ntTSL 515.43■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 SLC25A10-206ENST00000573246 898 ntTSL 314.37□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.162e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DLG1-209ENST00000419553 582 ntTSL 213.15□□□□□ -0.31e-7■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 ALDH3A2-219ENST00000579855 3583 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 ALDH3A2-203ENST00000395575 3640 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 XPO7-202ENST00000433566 4519 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.612e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DLG1-215ENST00000448528 2977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.621e-7■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DLG1-205ENST00000392382 2690 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.621e-7■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 ALDH3A2-202ENST00000339618 3828 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.672e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DLG1-201ENST00000346964 5034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.711e-7■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 ALDH3A2-206ENST00000472059 3710 ntTSL 210.48□□□□□ -0.732e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 HSP90AA1-204ENST00000554401 1710 ntTSL 1 (best)8.88□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.991e-7■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.081e-7■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 DLG1-223ENST00000471733 2605 ntTSL 1 (best)7.41□□□□□ -1.221e-7■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 ALDH3A2-210ENST00000573505 3512 nt6.82□□□□□ -1.322e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 HSP90AA1-203ENST00000553585 581 ntTSL 36.31□□□□□ -1.42e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 HSP90AA1-205ENST00000555662 429 ntTSL 25.86□□□□□ -1.472e-6■□□□□ 9.4
GRSF1Q12849 WDR6-216ENST00000489684 1155 ntTSL 217.13■□□□□ 0.333e-17■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)12.05□□□□□ -0.483e-17■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.613e-17■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.344e-13■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.064e-13■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.464e-13■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.944e-13■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.154e-13■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 FARP1-224ENST00000598389 747 ntTSL 56.64□□□□□ -1.354e-13■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 ARL6IP1-207ENST00000567969 581 ntTSL 219.92■□□□□ 0.781e-8■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 ARL6IP1-206ENST00000566391 806 ntTSL 219.66■□□□□ 0.741e-8■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 ARL6IP1-203ENST00000562234 391 ntTSL 518.12■□□□□ 0.491e-8■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-8■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 ARL6IP1-208ENST00000569976 778 ntTSL 215.49■□□□□ 0.071e-8■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.181e-8■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.291e-8■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 ARL6IP1-205ENST00000563861 948 ntTSL 1 (best)6.16□□□□□ -1.421e-8■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 TMEM62-214ENST00000569926 500 ntTSL 323.53■■□□□ 1.365e-6■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.715e-6■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.75e-6■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 TMEM62-209ENST00000568182 493 ntTSL 318.62■□□□□ 0.575e-6■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 TMEM62-208ENST00000567441 627 ntTSL 318.13■□□□□ 0.495e-6■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 TMEM62-215ENST00000570109 524 ntTSL 218.11■□□□□ 0.495e-6■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 SSR1-205ENST00000475213 446 ntTSL 312.98□□□□□ -0.335e-6■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 ORMDL3-203ENST00000579287 349 ntTSL 312.68□□□□□ -0.387e-10■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 TMEM62-210ENST00000568197 356 ntTSL 311.27□□□□□ -0.615e-6■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 TMEM62-204ENST00000564698 571 ntTSL 48.51□□□□□ -1.055e-6■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.235e-6■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 TMEM62-212ENST00000569535 573 ntTSL 55.6□□□□□ -1.515e-6■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 TMEM62-205ENST00000565291 566 ntTSL 43.98□□□□□ -1.775e-6■□□□□ 9.3
GRSF1Q12849 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.13e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.083e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 ECHDC2-225ENST00000544365 1335 ntTSL 521.33■■□□□ 1.013e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 ECHDC2-206ENST00000467988 702 ntTSL 521.24■□□□□ 0.993e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.893e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 ECHDC2-219ENST00000495920 456 ntTSL 320.47■□□□□ 0.873e-8■□□□□ 9.2
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