Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
StumQ0VBF8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
StumQ0VBF8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
StumQ0VBF8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
StumQ0VBF8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
StumQ0VBF8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
StumQ0VBF8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
StumQ0VBF8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
StumQ0VBF8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
StumQ0VBF8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
StumQ0VBF8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
StumQ0VBF8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
StumQ0VBF8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
StumQ0VBF8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
StumQ0VBF8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
StumQ0VBF8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
StumQ0VBF8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
StumQ0VBF8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
StumQ0VBF8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms