Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms