Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNA1Q09470 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms