Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms