Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2C1P98194 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms