Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VldlrP98156 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VldlrP98156 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VldlrP98156 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VldlrP98156 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VldlrP98156 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VldlrP98156 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VldlrP98156 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VldlrP98156 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VldlrP98156 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms