Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp2P97473 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp2P97473 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms