Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct3P80318 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct3P80318 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct3P80318 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct3P80318 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct3P80318 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct3P80318 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cct3P80318 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms