Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF3P78545 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF3P78545 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF3P78545 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF3P78545 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF3P78545 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF3P78545 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF3P78545 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF3P78545 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF3P78545 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF3P78545 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF3P78545 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF3P78545 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF3P78545 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF3P78545 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF3P78545 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF3P78545 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF3P78545 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF3P78545 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF3P78545 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF3P78545 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF3P78545 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF3P78545 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF3P78545 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF3P78545 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF3P78545 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF3P78545 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF3P78545 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF3P78545 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF3P78545 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF3P78545 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF3P78545 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ELF3P78545 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ELF3P78545 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF3P78545 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF3P78545 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF3P78545 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF3P78545 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF3P78545 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF3P78545 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF3P78545 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF3P78545 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF3P78545 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF3P78545 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF3P78545 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF3P78545 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF3P78545 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF3P78545 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF3P78545 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF3P78545 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF3P78545 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF3P78545 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF3P78545 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF3P78545 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF3P78545 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF3P78545 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF3P78545 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF3P78545 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF3P78545 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF3P78545 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF3P78545 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF3P78545 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF3P78545 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF3P78545 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF3P78545 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF3P78545 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF3P78545 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF3P78545 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF3P78545 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF3P78545 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF3P78545 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF3P78545 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF3P78545 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF3P78545 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF3P78545 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF3P78545 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF3P78545 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF3P78545 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF3P78545 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF3P78545 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF3P78545 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ELF3P78545 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELF3P78545 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ELF3P78545 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELF3P78545 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELF3P78545 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELF3P78545 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms