Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cux2P70298 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cux2P70298 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cux2P70298 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Cux2P70298 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cux2P70298 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cux2P70298 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Cux2P70298 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Cux2P70298 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cux2P70298 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Cux2P70298 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Cux2P70298 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Cux2P70298 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cux2P70298 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cux2P70298 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cux2P70298 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cux2P70298 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cux2P70298 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cux2P70298 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cux2P70298 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cux2P70298 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cux2P70298 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cux2P70298 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cux2P70298 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cux2P70298 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cux2P70298 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cux2P70298 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Cux2P70298 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Cux2P70298 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cux2P70298 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cux2P70298 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cux2P70298 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cux2P70298 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Cux2P70298 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Cux2P70298 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Cux2P70298 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cux2P70298 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cux2P70298 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cux2P70298 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Cux2P70298 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cux2P70298 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cux2P70298 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Cux2P70298 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cux2P70298 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cux2P70298 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cux2P70298 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Cux2P70298 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cux2P70298 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Cux2P70298 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cux2P70298 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Cux2P70298 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cux2P70298 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms