Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 777.6 ms