Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubgcp3P58854 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp3P58854 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms