Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms