Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CratP47934 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CratP47934 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CratP47934 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CratP47934 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CratP47934 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CratP47934 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CratP47934 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CratP47934 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CratP47934 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CratP47934 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CratP47934 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CratP47934 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CratP47934 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CratP47934 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CratP47934 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CratP47934 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CratP47934 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CratP47934 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CratP47934 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CratP47934 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CratP47934 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CratP47934 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CratP47934 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CratP47934 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CratP47934 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CratP47934 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CratP47934 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CratP47934 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CratP47934 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CratP47934 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CratP47934 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CratP47934 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CratP47934 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CratP47934 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CratP47934 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CratP47934 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CratP47934 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CratP47934 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CratP47934 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CratP47934 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CratP47934 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CratP47934 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CratP47934 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CratP47934 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CratP47934 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CratP47934 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CratP47934 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CratP47934 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CratP47934 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CratP47934 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CratP47934 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CratP47934 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CratP47934 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CratP47934 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CratP47934 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CratP47934 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CratP47934 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms