Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkn1bP46414 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms