Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab20P35295 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab20P35295 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab20P35295 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab20P35295 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab20P35295 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab20P35295 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab20P35295 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab20P35295 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab20P35295 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab20P35295 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab20P35295 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab20P35295 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab20P35295 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab20P35295 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms