Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SsbP32067 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SsbP32067 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SsbP32067 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SsbP32067 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SsbP32067 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SsbP32067 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SsbP32067 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SsbP32067 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SsbP32067 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SsbP32067 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SsbP32067 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SsbP32067 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SsbP32067 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SsbP32067 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SsbP32067 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SsbP32067 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SsbP32067 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SsbP32067 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SsbP32067 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SsbP32067 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SsbP32067 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SsbP32067 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SsbP32067 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SsbP32067 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SsbP32067 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SsbP32067 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SsbP32067 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SsbP32067 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SsbP32067 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SsbP32067 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SsbP32067 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SsbP32067 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SsbP32067 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SsbP32067 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SsbP32067 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SsbP32067 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SsbP32067 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SsbP32067 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SsbP32067 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SsbP32067 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SsbP32067 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SsbP32067 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SsbP32067 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SsbP32067 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SsbP32067 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SsbP32067 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SsbP32067 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SsbP32067 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SsbP32067 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SsbP32067 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SsbP32067 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SsbP32067 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SsbP32067 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SsbP32067 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SsbP32067 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SsbP32067 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SsbP32067 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SsbP32067 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SsbP32067 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SsbP32067 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SsbP32067 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SsbP32067 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SsbP32067 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SsbP32067 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SsbP32067 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SsbP32067 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SsbP32067 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SsbP32067 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SsbP32067 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SsbP32067 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SsbP32067 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SsbP32067 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms