Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc10P31257 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176 ms