Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Znf239P24399 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf239P24399 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Znf239P24399 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf239P24399 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf239P24399 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf239P24399 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf239P24399 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf239P24399 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf239P24399 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf239P24399 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf239P24399 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf239P24399 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf239P24399 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf239P24399 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Znf239P24399 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Znf239P24399 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf239P24399 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf239P24399 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf239P24399 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf239P24399 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf239P24399 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf239P24399 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf239P24399 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf239P24399 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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Znf239P24399 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Znf239P24399 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf239P24399 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Znf239P24399 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Znf239P24399 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Znf239P24399 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Znf239P24399 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Znf239P24399 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Znf239P24399 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Znf239P24399 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf239P24399 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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