Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc6P23475 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms