Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFNA1P20827 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFNA1P20827 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFNA1P20827 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
EFNA1P20827 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFNA1P20827 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA1P20827 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA1P20827 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA1P20827 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA1P20827 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA1P20827 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA1P20827 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA1P20827 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA1P20827 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA1P20827 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA1P20827 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA1P20827 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA1P20827 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA1P20827 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA1P20827 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA1P20827 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA1P20827 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA1P20827 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA1P20827 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA1P20827 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EFNA1P20827 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA1P20827 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA1P20827 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA1P20827 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA1P20827 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA1P20827 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA1P20827 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EFNA1P20827 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA1P20827 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA1P20827 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA1P20827 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms