Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF35P13682 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF35P13682 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF35P13682 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF35P13682 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF35P13682 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF35P13682 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF35P13682 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF35P13682 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF35P13682 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF35P13682 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF35P13682 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF35P13682 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF35P13682 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms