Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BMP3P12645 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BMP3P12645 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BMP3P12645 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BMP3P12645 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BMP3P12645 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BMP3P12645 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BMP3P12645 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BMP3P12645 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BMP3P12645 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BMP3P12645 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BMP3P12645 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BMP3P12645 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BMP3P12645 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BMP3P12645 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP3P12645 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BMP3P12645 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BMP3P12645 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BMP3P12645 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BMP3P12645 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BMP3P12645 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BMP3P12645 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BMP3P12645 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BMP3P12645 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BMP3P12645 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BMP3P12645 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BMP3P12645 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BMP3P12645 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BMP3P12645 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BMP3P12645 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BMP3P12645 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BMP3P12645 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BMP3P12645 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BMP3P12645 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BMP3P12645 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BMP3P12645 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BMP3P12645 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BMP3P12645 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BMP3P12645 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BMP3P12645 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BMP3P12645 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BMP3P12645 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BMP3P12645 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BMP3P12645 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BMP3P12645 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BMP3P12645 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BMP3P12645 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BMP3P12645 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BMP3P12645 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BMP3P12645 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BMP3P12645 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BMP3P12645 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BMP3P12645 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BMP3P12645 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BMP3P12645 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BMP3P12645 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
BMP3P12645 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BMP3P12645 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BMP3P12645 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BMP3P12645 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BMP3P12645 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BMP3P12645 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BMP3P12645 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BMP3P12645 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BMP3P12645 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BMP3P12645 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BMP3P12645 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BMP3P12645 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BMP3P12645 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BMP3P12645 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BMP3P12645 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BMP3P12645 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BMP3P12645 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BMP3P12645 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BMP3P12645 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BMP3P12645 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BMP3P12645 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BMP3P12645 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BMP3P12645 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BMP3P12645 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BMP3P12645 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BMP3P12645 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BMP3P12645 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BMP3P12645 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BMP3P12645 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BMP3P12645 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BMP3P12645 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms