Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC1P11940 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms