Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF888P0CJ79 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms