Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYPP08247 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYPP08247 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYPP08247 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYPP08247 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYPP08247 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYPP08247 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPP08247 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPP08247 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPP08247 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPP08247 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPP08247 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPP08247 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPP08247 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPP08247 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPP08247 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPP08247 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPP08247 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPP08247 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPP08247 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYPP08247 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPP08247 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPP08247 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPP08247 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPP08247 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPP08247 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPP08247 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPP08247 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPP08247 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPP08247 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPP08247 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPP08247 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPP08247 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPP08247 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPP08247 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPP08247 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPP08247 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPP08247 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPP08247 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPP08247 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPP08247 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPP08247 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPP08247 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPP08247 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPP08247 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPP08247 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPP08247 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPP08247 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPP08247 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPP08247 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPP08247 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPP08247 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPP08247 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPP08247 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPP08247 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPP08247 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPP08247 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPP08247 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPP08247 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPP08247 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPP08247 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYPP08247 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYPP08247 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYPP08247 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPP08247 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPP08247 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPP08247 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPP08247 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPP08247 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPP08247 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPP08247 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPP08247 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPP08247 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPP08247 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPP08247 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYPP08247 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYPP08247 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYPP08247 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYPP08247 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYPP08247 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYPP08247 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYPP08247 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYPP08247 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYPP08247 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYPP08247 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYPP08247 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYPP08247 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYPP08247 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYPP08247 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPP08247 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPP08247 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPP08247 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPP08247 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPP08247 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPP08247 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPP08247 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPP08247 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPP08247 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPP08247 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPP08247 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms