Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB1P08034 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB1P08034 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB1P08034 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB1P08034 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB1P08034 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB1P08034 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB1P08034 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB1P08034 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB1P08034 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB1P08034 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB1P08034 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB1P08034 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB1P08034 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB1P08034 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB1P08034 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB1P08034 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB1P08034 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB1P08034 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB1P08034 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB1P08034 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB1P08034 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB1P08034 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB1P08034 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB1P08034 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB1P08034 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB1P08034 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB1P08034 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB1P08034 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB1P08034 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB1P08034 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB1P08034 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB1P08034 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB1P08034 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB1P08034 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB1P08034 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB1P08034 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB1P08034 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB1P08034 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB1P08034 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB1P08034 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB1P08034 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB1P08034 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB1P08034 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB1P08034 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB1P08034 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB1P08034 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB1P08034 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB1P08034 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB1P08034 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB1P08034 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB1P08034 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB1P08034 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB1P08034 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB1P08034 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB1P08034 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB1P08034 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB1P08034 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB1P08034 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB1P08034 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB1P08034 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GJB1P08034 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
GJB1P08034 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB1P08034 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB1P08034 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB1P08034 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB1P08034 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB1P08034 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB1P08034 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB1P08034 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB1P08034 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB1P08034 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB1P08034 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB1P08034 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB1P08034 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB1P08034 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB1P08034 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB1P08034 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB1P08034 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB1P08034 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB1P08034 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB1P08034 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB1P08034 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB1P08034 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms