Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B2mP01887 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B2mP01887 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B2mP01887 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B2mP01887 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B2mP01887 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B2mP01887 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B2mP01887 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B2mP01887 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B2mP01887 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B2mP01887 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B2mP01887 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B2mP01887 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B2mP01887 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B2mP01887 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B2mP01887 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B2mP01887 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B2mP01887 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B2mP01887 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B2mP01887 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B2mP01887 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
B2mP01887 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B2mP01887 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B2mP01887 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B2mP01887 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B2mP01887 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B2mP01887 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B2mP01887 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B2mP01887 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B2mP01887 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B2mP01887 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B2mP01887 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B2mP01887 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B2mP01887 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B2mP01887 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B2mP01887 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
B2mP01887 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B2mP01887 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
B2mP01887 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B2mP01887 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B2mP01887 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B2mP01887 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B2mP01887 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B2mP01887 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B2mP01887 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
B2mP01887 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B2mP01887 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B2mP01887 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B2mP01887 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B2mP01887 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B2mP01887 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B2mP01887 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B2mP01887 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B2mP01887 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B2mP01887 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B2mP01887 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B2mP01887 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B2mP01887 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B2mP01887 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B2mP01887 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B2mP01887 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B2mP01887 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
B2mP01887 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B2mP01887 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B2mP01887 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms