Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01746 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01746 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01746 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01746 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01746 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01746 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01746 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01746 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01746 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01746 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01746 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01746 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01746 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01746 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01746 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01746 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01746 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01746 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01746 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01746 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01746 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01746 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01746 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01746 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01746 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01746 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01746 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01746 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01746 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01746 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01746 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01746 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01746 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01746 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01746 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01746 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01746 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01746 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01746 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01746 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01746 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01746 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01746 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01746 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01746 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01746 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01746 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P01746 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01746 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01746 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01746 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P01746 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01746 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P01746 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01746 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01746 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01746 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01746 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01746 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01746 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01746 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
P01746 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01746 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01746 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01746 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01746 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01746 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01746 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01746 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01746 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01746 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01746 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01746 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01746 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01746 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01746 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01746 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01746 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01746 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01746 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P01746 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01746 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01746 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01746 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01746 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01746 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01746 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P01746 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01746 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01746 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01746 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01746 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01746 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01746 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01746 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01746 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
P01746 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
P01746 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
P01746 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms