Protein–RNA interactions for Protein: O88952

Lin7c, Protein lin-7 homolog C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7cO88952 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin7cO88952 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin7cO88952 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms