Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Orc4O88708 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Orc4O88708 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Orc4O88708 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Orc4O88708 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Orc4O88708 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Orc4O88708 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Orc4O88708 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Orc4O88708 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms