Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dnmt3aO88508 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3aO88508 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3aO88508 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms