Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CaskO70589 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CaskO70589 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CaskO70589 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaskO70589 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaskO70589 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaskO70589 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaskO70589 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaskO70589 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaskO70589 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaskO70589 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaskO70589 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaskO70589 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaskO70589 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaskO70589 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaskO70589 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaskO70589 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaskO70589 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaskO70589 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CaskO70589 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaskO70589 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaskO70589 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaskO70589 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaskO70589 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaskO70589 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaskO70589 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaskO70589 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaskO70589 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaskO70589 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaskO70589 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaskO70589 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaskO70589 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CaskO70589 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaskO70589 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaskO70589 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaskO70589 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CaskO70589 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaskO70589 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaskO70589 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaskO70589 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaskO70589 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaskO70589 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaskO70589 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaskO70589 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CaskO70589 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CaskO70589 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CaskO70589 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CaskO70589 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CaskO70589 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CaskO70589 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CaskO70589 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CaskO70589 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CaskO70589 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CaskO70589 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CaskO70589 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CaskO70589 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CaskO70589 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CaskO70589 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CaskO70589 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CaskO70589 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CaskO70589 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CaskO70589 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CaskO70589 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CaskO70589 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CaskO70589 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CaskO70589 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CaskO70589 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CaskO70589 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CaskO70589 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CaskO70589 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CaskO70589 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CaskO70589 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms