Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNSO60931 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNSO60931 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNSO60931 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNSO60931 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNSO60931 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNSO60931 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNSO60931 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNSO60931 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNSO60931 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNSO60931 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNSO60931 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNSO60931 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNSO60931 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNSO60931 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNSO60931 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNSO60931 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNSO60931 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNSO60931 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNSO60931 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNSO60931 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNSO60931 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNSO60931 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNSO60931 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNSO60931 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNSO60931 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNSO60931 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNSO60931 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNSO60931 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNSO60931 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNSO60931 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNSO60931 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNSO60931 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNSO60931 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNSO60931 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNSO60931 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNSO60931 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNSO60931 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNSO60931 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNSO60931 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNSO60931 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNSO60931 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNSO60931 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNSO60931 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNSO60931 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNSO60931 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNSO60931 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNSO60931 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNSO60931 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNSO60931 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNSO60931 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNSO60931 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNSO60931 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNSO60931 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNSO60931 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNSO60931 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNSO60931 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNSO60931 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNSO60931 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNSO60931 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNSO60931 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNSO60931 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNSO60931 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNSO60931 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNSO60931 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNSO60931 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNSO60931 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNSO60931 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNSO60931 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNSO60931 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNSO60931 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNSO60931 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNSO60931 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNSO60931 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNSO60931 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNSO60931 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNSO60931 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNSO60931 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNSO60931 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNSO60931 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNSO60931 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNSO60931 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNSO60931 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms