Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms