Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf5O35445 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms