Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-ObO35424 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms