Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DFFAO00273 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DFFAO00273 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DFFAO00273 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DFFAO00273 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DFFAO00273 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DFFAO00273 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DFFAO00273 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DFFAO00273 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DFFAO00273 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DFFAO00273 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DFFAO00273 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DFFAO00273 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DFFAO00273 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DFFAO00273 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DFFAO00273 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DFFAO00273 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DFFAO00273 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DFFAO00273 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DFFAO00273 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DFFAO00273 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DFFAO00273 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DFFAO00273 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DFFAO00273 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DFFAO00273 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DFFAO00273 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DFFAO00273 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DFFAO00273 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DFFAO00273 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DFFAO00273 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DFFAO00273 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DFFAO00273 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DFFAO00273 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DFFAO00273 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DFFAO00273 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DFFAO00273 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DFFAO00273 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DFFAO00273 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DFFAO00273 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DFFAO00273 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DFFAO00273 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DFFAO00273 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DFFAO00273 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DFFAO00273 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DFFAO00273 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DFFAO00273 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFAO00273 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFAO00273 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFAO00273 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DFFAO00273 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms