Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms