Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vwa3bJ9JI28 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms